हमारी वर्तमान रुचियों में प्रोटीन अनुक्रम विश्लेषण, प्रोटीन संरचना भविष्यवाणी, इसका एनोटेशन और बायोमोलेक्युलर मॉडलिंग शामिल है जिसमें सिमुलेशन/सिमुलेशन करने के लिए नियोजित बल क्षेत्रों की तुलना पर जोर दिया गया है। हम मौजूदा जटिल संरचनाओं और उनके सिमुलेशन के विश्लेषण द्वारा प्रोटीन-डीएनए इंटरैक्शन के लिए नियम प्राप्त करने के लिए विशेष रूप से रणनीति विकसित कर रहे हैं। हम प्रोटीन के मॉडलिंग में भी शामिल हैं ताकि सिलिको बायोलॉजी उपकरणों का उपयोग करके उनके संरचनात्मक और कार्यात्मक एनोटेशन को सुविधाजनक बनाया जा सके।

• कौर आर, आहूजा एस, आनंद ए, सिंह बी, स्टार्क बीसी, वेबस्टर डीए, दीक्षित केएल। (2008) विट्रोस्किला हीमोग्लोबिन (वीएचबी) में समीपस्थ साइट हाइड्रोजन बॉन्डिंग नेटवर्क के कार्यात्मक निहितार्थ: टायर95 (जी5) और टायर126 (एच12) की भूमिका। एफईबीएस लेट., 582(23-24):3494-500.
• कपूर डी, कुमार वी, चंद्रायन एसके, अहमद एस, शर्मा एस, दत्त एम, सिंह बी, कार्तिकेयन एस, गुप्तासर्मा पी. (2008) एक थर्मोफाइल प्रोटीन की सक्रिय सतह को एक समजात मेसोफाइल प्रोटीन द्वारा प्रतिस्थापित करना संरचना-निर्देशित 'प्रोटीन सतह ग्राफ्टिंग' बायोचिम बायोफिस एक्टा। 1784(11):1771-6.
• सक्सेना आर, कनुडिया पी, दत्त एम, डार एचएच, कार्तिकेयन एस, सिंह बी, चक्रवर्ती पीके। (2008) माइकोबैक्टीरियल पेप्टाइड डिफॉर्माइलेज एंजाइम गतिविधि के लिए लगातार तीन आर्जिनिन महत्वपूर्ण हैं। जे बायोल रसायन. 283(35): 23754-64.
• बछावत एन, सिंह बी. (2007) माइकोबैक्टीरियल पीई_पीजीआरएस प्रोटीन में समानांतर बीटा-रोल फोल्ड के साथ कैल्शियम-बाइंडिंग मोटिफ्स होते हैं। जीनोमिक्स प्रोटिओमिक्स जैव सूचना विज्ञान। 5:236-41.
• सिंह, बी (2004) पेपबिल्ड: पेप्टाइड/प्रोटीन के लिए संरचना डेटा बनाने के लिए एक वेब सर्वर। न्यूक्लिक एसिड रेस., 32:W559-W561.