डॉ. दीपक शर्मा

डॉ. दीपक शर्मा

वरिष्ठ प्रधान वैज्ञानिक

अनुसंधान रुचियां: हम मुख्य रूप से न्यूरोडीजेनेरेटिव रोगों के संदर्भ में चैपरोन मशीनरी को समझने में रुचि रखते हैं। मुख्य फोकस सेलुलर कारकों में अंतर्दृष्टि प्राप्त करना है जो ऑटोफैगी जैसी प्रक्रियाओं के माध्यम से पार्किंसंस रोग से जुड़े प्रोटीन के फोल्डिंग या गिरावट में चैपरोन फ़ंक्शन को नियंत्रित करते हैं।

चैपेरोन-मध्यस्थ ऑटोफैगी (सीएमए): केएफईआरक्यू जैसे रूपांकनों वाले सेलुलर प्रोटीन तनाव के तहत लाइसोसोम में स्थानांतरित हो जाते हैं। साइटोसोलिक Hsp70 ऐसे सब्सट्रेट्स को पहचानकर और उन्हें लाइसोसोम पर LAMP-2A रिसेप्टर प्रोटीन में स्थानांतरित करके प्रक्रिया में महत्वपूर्ण भूमिका निभाता है। हम न्यूरोनल कोशिकाओं में CMA में Hsp70s की भूमिका के नियामक पहलुओं की खोज कर रहे हैं।

आरएनएफैगी: आरएनए तनाव के तहत लाइसोसोम/रिधानिका में परिवर्तित हो जाता है। हम सेलुलर मशीनरी के विभिन्न घटकों की खोज कर रहे हैं जो इस प्रक्रिया को नियंत्रित करते हैं।

Hsp70 इंटरैक्टोम: यूकेरियोट्स कई साइटोसोलिक Hsp70s को एनकोड करते हैं जिनमें से कुछ संवैधानिक होते हैं और अन्य तनाव-प्रेरक होते हैं। Hsp70s Hsp40s और न्यूक्लियोटाइड विनिमय कारकों (NEF) के साथ परस्पर क्रिया करते हैं। Hsp70s के समान, कई Hsp40s और NEF हैं। हम यह पता लगा रहे हैं कि क्या विशिष्ट Hsp70-Hsp40-NEF कॉम्प्लेक्स विभिन्न सेलुलर स्थितियों के तहत बनते हैं, और यदि बनते हैं तो ऐसे नेटवर्क का कार्यात्मक महत्व क्या है।

प्रयोगशाला सेलुलर मॉडल जैसे कि यीस्ट और स्तनधारी कोशिकाओं या पशु मॉडल जैसे सी. एलिगेंस और पार्किंसंस रोग के माउस मॉडल का उपयोग करती है।

  • Bajaj M., Muddassir M., Choi B., Singh P., Park J.B. , Singh S., Yadav M. Kumar R., Eom K., Sharma D. (Int J Biol Macromol. 2023) Single-molecule analysis of osmolyte-mediated nanomechanical unfolding behavior of a protein domain.
  • Gaur D, Kumar N, Ghosh A, Singh P, Kumar P, Guleria J, Kaur S, Malik N, Saha S, Nystrom T, Sharma D (Plos Genetics, 2022), Ydj1 interaction at nucleotide-binding-domain of yeast Ssa1 impacts Hsp90 collaboration and client maturation.
  • Puri A, Singh P, Kumar N, Kumar R, Sharma D. Tah1, a key component of R2TP complex that regulates assembly of snoRNP, is involved in de novo generation and maintenance of yeast prion [URE3]. J Mol Biol, 2021
  • Kumar P, Sahoo D. K., Sharma D. The identification of novel promoters and terminators for protein expression and metabolic engineering applications in Kluyveromyces marxianus. Metab Eng Commun, 2021
  • Gaur D, Singh P, Guleria J, Gupta A, Kaur S, Sharma D. The yeast Hsp70 co-chaperone Ydj1 regulates functional distinction of Ssa Hsp70s in the Hsp90 chaperoning pathway. Genetics, 2020

डॉ. दीपक शर्मा के लैब सदस्य

  • Potent peptide inhibitors of protein aggregation- USA-16/647,149
  • Novel peptide as potent inhibitor of protein aggregation (Japan-7210560)
  • Potent peptide Inhibitors of protein aggregation (0121NF2017_EP)
  • Recombinant vector for high-expression of proteins in yeasts (China-ZL202080060401.X, CN 114341358 B)
प्रयोगशाला: 2880478
deepaks[at]imtech[dot]res[dot]in
+91-172-2880478

अंतिम संशोधित तिथि :- 20-12-2024