मेरी प्रयोगशाला 2004 से एंटीवायरल (siRNA, miRNA, पेप्टाइड्स, कंपाउंड्स), वायरोमिक्स, जीनोम-वाइड आरएनएआई, वैक्सीन एपिटोप्स, कोरम पर जोर देने के साथ जैविक समस्याओं को हल करने के लिए कम्प्यूटेशनल संसाधन, भविष्यवाणी एल्गोरिदम, वेब सर्वर, डेटाबेस और बड़े डेटा विश्लेषण विकसित कर रही है। सेंसिंग/बायो-फिल्म, सीआरआईएसपीआर/कैस आधारित जीनोम संपादन और वायरल एनजीएस डेटा विश्लेषण (http://bioinfo.imtech.res.in/manojk/)। हम एनजीएस दृष्टिकोण का उपयोग करके डेंगू/फ्लेविवायरस के खिलाफ एंटीवायरल के विकास और भारतीय वायरोम अन्वेषण पर ध्यान केंद्रित कर रहे हैं। इससे पहले, मैंने 1996 से 2004 तक राष्ट्रीय रोग नियंत्रण केंद्र, दिल्ली में जैव सुरक्षा आवश्यकताओं (बीएसएल-2/3) के तहत भारत में प्रमुख महामारी/प्रकोप में शामिल एटियलॉजिकल रोगज़नक़ों के आणविक लक्षण वर्णन (विशेष रूप से डेंगू, एचआईवी, इन्फ्लूएंजा, हेपेटाइटिस, आदि) में काम किया था। .

• गुप्ता, ए.के., कौर, के., राजपूत, ए., ढांडा, एस.के., सहगल, एम., खान, एम.एस., मोंगा, आई., डार, एस.ए., सिंह , एस., नागपाल, जी., उस्मानी, एस.एस., ठाकुर, ए., कौर, जी., शर्मा, एस., भारद्वाज, ए., कुरेशी, ए., राघव, जी.पी.एस., कुमार, एम*। (2016) ज़िकावीआर: जीनोमिक्स, प्रोटिओमिक्स, फ़ाइलोजेनेटिक और चिकित्सीय विश्लेषण के लिए एक एकीकृत ज़िका वायरस संसाधन। विज्ञान प्रतिनिधि. सितम्बर 16;6:32713। doi: 10.1038/srep32713
• राजपूत, ए., कौर, के., कुमार, एम.*. (2016) सिगमोल: प्रोकैरियोट्स में कोरम सेंसिंग सिग्नलिंग अणुओं का भंडार। न्यूक्लिक एसिड रेस. जनवरी 4;44(डी1):डी634-9। doi: 10.1093/nar/gkv1076.
• कौर, के.#, गुप्ता, ए.के.#, राजपूत, ए.#, कुमार, एम.* (2016) जीई-सीआरआईएसपीआर - भविष्यवाणी और विश्लेषण के लिए एक एकीकृत पाइपलाइन CRISPR/Cas प्रणाली के लिए sgRNAs जीनोम संपादन दक्षता। विज्ञान प्रतिनिधि सितम्बर 1;6:30870। doi: 10.1038/srep30870.
• डार, एस.ए., गुप्ता, ए.के., ठाकुर, ए., कुमार, एम.* (2016) एसएमईप्रेड वर्कबेंच: रासायनिक रूप से संशोधित siRNAs की प्रभावकारिता की भविष्यवाणी करने के लिए एक वेब सर्वर। आरएनए बायोल. 13(11):1144-1151. डीओआई: 10.1080/15476286.2016.1229733.
• ठाकुर, एन., कुरेशी, ए., कुमार, एम.*(2012) एवीपीप्रेड: अत्यधिक प्रभावी एंटीवायरल पेप्टाइड्स का संग्रह और भविष्यवाणी। न्यूक्लिक एसिड रेस. जुलाई;40(वेब सर्वर समस्या):W199-204। doi: 10.1093/nar/gks450.