हमारी शोध रुचि का दीर्घकालिक उद्देश्य एंजाइमों और प्रतिलेखन कारकों द्वारा आणविक पहचान के अव्यक्त नियामक तंत्र को उजागर करना और अन्य प्रणालियों में ऐसी घटनाओं का अध्ययन करने के लिए वैचारिक ढांचे का निर्माण करना है। हम अपने प्रायोगिक सिस्टम के रूप में मल्टी-एंजाइम और प्रोटीन-कॉम्प्लेक्स का उपयोग करते हैं। हमने हाल ही में एक नवीन "प्रतिस्पर्धी-एलोस्टरी" तंत्र की खोज की है जिसके द्वारा एक कम आत्मीयता-लिगैंड उच्च-आत्मीयता प्रतिपक्षी के पृथक्करण की सुविधा प्रदान कर सकता है। हम उत्प्रेरक के साथ-साथ प्रमोटर बाइंडिंग गुणों के साथ "एंजाइम-ट्रांसक्रिप्टन" कॉम्प्लेक्स भी डिजाइन करते हैं और चयापचय और ट्रांसक्रिप्शन के बीच नियामक लिंक का अध्ययन करते हैं।

• कौशिक ए, एक्का एम. के., कुमारन एस (2017) साल्मोनेला टाइफिम्यूरियम के सिस्टीन नियामक कॉम्प्लेक्स की दो अलग-अलग अवस्थाएं एंजाइम-सब्सट्रेट कॉग्नेट जोड़े द्वारा नियंत्रित होती हैं। जैव रसायन, 56, 2385-2399.
• सिंह एके, मंजासेट्टी बी, बालासुब्रमणि जीएल, कौल एस, कौशिक ए, एक्का एम, सिंह वी, और कुमारन एस (2015) अप्पो-स्टेट में माइकोबैक्टीरियम ट्यूबरकुलोसिस H37Ra से Fad35R की क्रिस्टल संरचना। प्लस वन, 10, e0124333.
• सिंह एके, सिंह एम, पंड्या वीके, बालासुब्रमणि जीएल, एक्का एम, मित्तल एम, कुमारन एस (2014) सैक्रोमाइसेस सेरेविसिया, बायोकैमिस्ट्री से मेटालोपेप्टाइडेज़ डग1पी में पेप्टाइड पहचान का आणविक आधार। 53, 7850-7883.
• सिंह वी, कृष्णा एमके, एकुमारन एस (2012) दूसरा मोनोमर बाइंडिंग कार्यात्मक PhoP-डीएनए डिमर, बायोकैमिस्ट्री, 51, 1346-1356 के निर्माण में दर सीमित करने वाला कदम है।
• पंड्या वीके, एक्का एमके, दत्ता आरके, कुमारन एस (2011)। डि-पेप्टिडेज़ के काइनेटिक गुणों के अध्ययन के लिए मास स्पेक्ट्रोमेट्री परख; मानव और यीस्ट डि-पेप्टिडेज़ की विशेषता। विश्लेषणात्मक जैव रसायन, 418, 134-142.